大規模な統合医療システムにおけるSARS-CoV-2変異株の分布 ― カリフォルニア州、2021年3月～7月

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MMWR抄訳

2021/10/08Vol. 70 / No. 40

MMWR70(40):1415－1419
Distribution of SARS-CoV-2 Variants in a Large Integrated Health Care System — California, March–July 2021

大規模な統合医療システムにおけるSARS-CoV-2変異株の分布 ― カリフォルニア州、2021年3月～7月

観察研究のデータから、COVID-19の原因ウイルスであるSARS-CoV-2の変異株が、多くの国で急速に進化していることが示されている。懸念される変異株のSARS-CoV-2 B.1.617.2(デルタ)株は、過去に確認された変異株よりも感染力が強く、2021年9月の時点で、アメリカで優勢変異株となっている。SARS-CoV-2変異株、特にデルタ変異株が原因のCOVID-19の分布および重症度を特徴付ける研究は、アメリカでは限られており、研究環境、検体収集、研究集団、研究期間に関連する制限を受けやすい。今回の研究では、大規模な統合医療システムであるKaiser Permanente Southern California(KPSC)全体で収集されたSARS-CoV-2陽性検体の全ゲノムシーケンシングデータを使用し、2021年3月4日～7月21日におけるSARS-CoV-2の分布と関連する入院リスクについて、患者の予防接種状況別に分析した。この期間にKPSCの患者で特定された13,039件のSARS-CoV-2陽性検体のうち、シーケンシングされた6,798件(52％)を今回の報告対象とした。これらのうち、5,994件(88％)はワクチン未接種者、648件(10％)はワクチン完全接種者から、156件(2%)はワクチン一部接種者から採取されたものであった。シーケンシングされたすべての検体の中で、B.1.1.7(アルファ)変異株感染の週ごとの割合は、2021年3月4日から5月19日にかけて20％から67％に増加した。また、2021年4月15日から7月21日にかけて、デルタ変異株感染の週ごとの割合は0％から95％に増加した。2021年3月4日～7月21日における変異株の週ごとの割合はワクチン完全接種者と未接種者同様であったが、デルタ変異株に起因する感染割合は、他の変異株と比較して、ワクチン接種者にて未接種者よりも多かった。デルタ変異株は若年者で多く、18～44歳で最も多く確認された(55％)。デルタ変異株に起因する感染症は、他の変異株と比較して、非ヒスパニック系黒人にて多く確認された。検体採取日の2日前から採取後14日以内に入院したのは、ワクチン接種者25例(3.9％)と未接種者393例(6.6％)であった。未接種者では、デルタ変異株による感染は他のすべての変異株と比較して、調整後の入院リスクの増加と関連していた。これらの調査結果は、特に、デルタ株がアメリカで流行している優勢変異株である期間中では、SARS-CoV-2変異株の継続的なモニタリングと複数のCOVID-19予防戦略の実施の重要性を強調している。

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