川崎病の原因はいまだ不明であるが、感染や環境因子などを要因とした免疫系の活性化が関与していると考えられている。インフルエンザワクチンは様々なタイプの血管炎を引き起こすことが報告されており、ワクチン接種後の免疫系の活性化による自己免疫反応の惹起が原因の１つとして考えられている。本症例においても、インフルエンザワクチン接種による免疫系の活性化が川崎病の発症と関連している可能性が考えられた。稀ではあるが、ワクチン接種後に川崎病を発症する可能性があるため、注意が必要である。