SARS-CoV-2変異株BA.2.86の早期検出とサーベイランス ― 全世界、2023年7月～10月

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MMWR抄訳

2023/10/27Vol. 72 / No. 43

MMWR72(43):1162－1167
Early Detection and Surveillance of the SARS-CoV-2 Variant BA.2.86 — Worldwide, July–October 2023

SARS-CoV-2変異株BA.2.86の早期検出とサーベイランス ― 全世界、2023年7月～10月

2023年8月13日、イスラエルにおいてSARS-CoV-2変異株BA.2.86が検出された。この新しい変異株はスパイク蛋白質に30以上の変異があり、他の変異株との塩基配列の乖離は、過去のSARS-CoV-2感染やワクチン接種による抗体防御が低下する可能性を示唆していた。そのためCDCは公衆衛生活動やサーベイランスの指針としてBA.2.86を積極的に監視しており、ここでは早期検出のための多要素サーベイランスシステム[National SARS-CoV-2 genomic surveillance、Traveler-related Genomic Surveillance(TGS)、National Wastewater Surveillance System(NWSS)、digital public health surveillance]によるSARS-CoV-2 BA.2.86変異株への対応について報告する。世界初のBA.2.86症例は2023年8月13日、イスラエルからGlobal Initiative on Sharing All Influenza Data (GISAID)に報告され、翌日、デンマークから2例目と3例目が報告された。8月17日、アメリカは4例目の患者を報告(ミシガン州)、同日、オハイオ州にて7月30日に採取された廃水検体から国内初のBA.2.86検出を報告し、その後10日間にてさらに9例の患者が報告された。呼吸器疾患例の報告国はイギリスと南アフリカが追加され、スイスとデンマークからは廃水からの検出が報告された。また、8月10日、日本からダレス国際空港(DC)に到着し、TGSに参加した旅行客から採取した検体からBA.2.86が検出され、20日に確認された。8月26日、オハイオ州は7月29日に採取した検体から患者を報告、この患者は9日前に廃水検体からの検出が報告された地域にいた。呼吸器検体からのもっとも早いBA.2.86の検出はデンマーク(7月24日)であり、アメリカでは7月29日であった。その後2週間以内に11例が報告され、検体採取からシーケンス報告までの期間中央値は14日(5～29日)であった。これら最初の14例が検出されたのち、BA.2.86は5大陸、少なくとも32カ国の呼吸器または廃水検体から検出され、10月23日現在、GISAIDにて公開されている945検体のデータでは、検体採取から報告までの期間中央値は15日(4～53日)、アメリカにて伝播している変異株の1％未満を占めている。BA.2.86の早期検出に関連するデータは迅速なリスクコミュニケーション(ウェブベースでの最新情報の提供)、ウイルスの分離と特徴の把握(CDCと配列決定ラボの連携、研究室との情報共有)および公衆衛生活動の相互調整を可能とした。

References

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