SARS-CoV-2変異株B.1.427およびB.1.429の同定とサーベイランス ― コロラド州、2021年1～3月

日本語
English

ホーム IMICライブラリ MMWR抄訳 2021年（Vol.70)SARS-CoV-2変異株B.1.427およびB.･･･

MMWR抄訳

2021/05/14Vol. 70 / No. 19

MMWR70(19):717－718
Identification of and Surveillance for the SARS-CoV-2 Variants B.1.427 and B.1.429 — Colorado, January–March 2021

SARS-CoV-2変異株B.1.427およびB.1.429の同定とサーベイランス ― コロラド州、2021年1～3月

COVID-19の原因ウイルスであるSARS-CoV-2の変異株B.1.427およびB.1.429は、2021年1月20日、カリフォルニア南部で初めて確認され、3月16日、懸念される変異株に指定された。1月24日、Colorado Department of Public Health and Environment(CDPHE)はこれらの変異株にコロラド州で初めて感染したCOVID-19症例を確認し、3月31日までに計327例のB.1.427/B.1.429株に感染したCOVID-19症例がCDPHEに報告された。これらの症例の検体は1月4日～3月20日に収集され、B.1.427株が90例(28％)、B.1.429株が218例(67％)、不明が19例(6％)であった。B.1.427/B.1.429症例は検体採取から中央値14.5日(7～38日)後に同定され、年齢中央値は39歳(1歳未満～95歳)、男性が186例(57％)であった。症例は、コロラド州64郡のうち31郡(48％)にて確認された。2月に変異株症例を対象としたインタビュー調査では60例が調査を完遂した。そのうち、9例(15％)が州外へ旅行していたが(カリフォルニア州3例、ネバダ州2例、ジョージア州、ミネソタ州、ユタ州、ワシントンDCが各1例)、海外渡航者はいなかった。症状に関する情報は211例から得られ、193例(91％)に症状があり、46例(14％)が入院、8例(2％)が死亡し、7例(2％)はブレイクスルー感染であった。コロラド州の変異株データは便宜的サンプル由来であり、全国的なSARS-CoV-2検査陽性患者における推定値の割合(症状あり85％、入院率5％)と比べた時、B.1.427/B.1.429株は全国で循環しているすべての系統のウイルスと比べ、重症化しやすい傾向を示している。検査した検体にB.1.427/B.1.429株が占める割合は、1月下旬の3～4％から3月上旬には20～22％に増加した。コロラド州のB.1.427/B.1.429株症例が増加し、これがbamlanivimabへの耐性と関連していることから、CDPHEは3月22日、bamlanivimab単独療法に対する警告をHealth Alert Network advisoryに発表した。4月16日、FDAはbamlanivimab単独療法の緊急使用許可を取り消した。

References

Zhang W, David BD, Chen SS, Sincuir Martinez JM, Plummer JT, Vail E. Emergence of a novel SARS-CoV-2 strain in Southern California, USA. [Preprint posted online January 20, 2021]. ＜https://doi.org/10.1101/2021.01.18.21249786＞
CDC. COVID-19: SARS-CoV-2 variant classifications and definitions. Atlanta, GA: US Department of Health and Human Services, CDC; 2021. ＜https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-updates/variant-surveillance/variant-info.html＞
Tchesnokova V, Kulakesara H, Larson L, et al. Acquisition of the L452R mutation in the ACE2-binding interface of Spike protein triggers recent massive expansion of SARS-Cov-2 variants. [Preprint posted online March 11, 2021]. ＜https://doi.org/10.1101/2021.02.22.432189＞
Chand M, Hopkins S, Dabrera G, et al. Investigation of novel SARS-CoV-2 variant: variant of concern 202012/01. London, England: Public Health England; 2020. ＜https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/959438/Technical_Briefing_VOC_SH_NJL2_SH2.pdf＞
Rambaut A, Holmes EC, O’Toole Á, et al. A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology. Nat Microbiol 2020;5:1403–7. PMID:32669681 ＜https://doi.org/10.1038/s41564-020-0770-5＞
Hadfield J, Megill C, Bell SM, et al. Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution. Bioinformatics 2018;34:4121–3. PMID:29790939 ＜https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty407＞